Бактерии и вирусы могут создавать инфекции толстой кишки. Пищевое происхождение имеет большинство подобных болезней. Это еще называют «пищевым отравлением». Очень распространены бактерии шигелла, сальмонелла, кишечная палочка и кампилобактеры.

Данные инфекции могут спровоцировать кровавую диарею, что приводит к серьезному обезвоживанию. Такие паразиты, как лямблии, часто, вызывают сильную диарею. Есть вероятность попадания паразита в организм при употреблении зараженной воды. Источником выступает вода в озерах, бассейнах, реках. Эти бактерии могут жить в грязной воде из цистерны или колодца.

Псевдомембранозный колит вызывается бактериями под названием клостридиум диффициле (C. difficile). Эта болезнь часто выявляется у пациентов, которые в недавнем времени принимали антибиотики для лечения инфекций. Такие препараты воздействуют на обычные бактерии толстой кишки и способствуют размножению бактерий клостридиум. Бактерии клостридиум продуцируют токсин, вызывающий диарею. Инфекция часто протекает с лихорадкой. Диарея обычно без крови.